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DNA基础知识

作者:陕西保健网
来源:http://www.xapfxb.com/yuer
更新日期:2021-02-28 16:10

-

2021年2月28日发(作者:血参)
Chelex
法提取血液(斑)
DNA
原理
:
Chelex
是由苯乙烯与二乙烯苯的共聚体组成的螯合树脂,其亚氨基二乙酸侧链起着螯合 金属离子的作用,防止在
其煮沸过程中
DNA
的降解,在高温低离子强度下也起着催化
DNA
释放的作用。

对检材的条件要求

液体血用
EDTA
溶液(
0.5M EDTA
:血
=50
μ
l

3ml
)或枸橼酸钠溶 液(
2.5%
枸橼酸钠:血
=1

4
)抗凝,勿用肝
素抗凝,须冷藏保存送检。

操作步骤
:
1


4
μ
l
血液(或
3
×
3mm2
血斑样品)放入< br>0.5ml
的离心管中,加入
0.5ml
纯水,振荡混匀,室温浸泡
1 5-30
分钟。

2

13,000rpm
离心
3
分钟,去除上清液〔上清液可用于做抗人血红蛋白(
FOB
)金标试剂条检验〕,若是血斑则保
留载体。

3
、加入
200
μ
l 5% Chelex-100
溶液,
56
o
C
保温
15-30
分钟,振荡
5-10
秒。

4
、沸水中煮
8
分钟(或在热循环仪上
100
o
C
保温
8
分钟),振荡
5-10
秒。

5

13,000rpm
离心
3
分钟,
4
o
C
保存备用。

注意事项:

1

5% Chelex-100
溶液使用前摇匀,用量视检材的量而定。

2
、液体血用
EDTA
溶液(
0.5M EDTA
:血
=50
μ
l
3ml
)或枸橼酸钠溶液(
2.5%
枸橼酸钠:血
=1

4
)抗凝,冷藏
送检。

3
、液体血涂在滤纸或脱脂纱布上制成血 斑时,应在室温下自然晾干,放入纸袋内送检。

4
、血斑应保留载体,皮革上的血迹最好用纱线转移提取。

5
、纯水洗一次后,若颜色还很红,可用水再洗一遍。

6
、微量血斑可不经水洗,直接加入适量
5% Chelex-100
溶液保温。

7
、陈旧血斑可加入蛋白酶
K
,并适当延长保温时间。

Chelex
法提取唾液(斑)
DNA
适用范围:

该方法适用于各种载体上的唾液斑,常见的有口腔拭子、烟蒂、邮票、信封折口、

牙刷、果核、饮料罐、水杯、面罩及咬痕等。

原理:

Chelex
是由苯乙烯与二乙烯苯的共聚体组成的螯合树脂,其亚氨基二乙酸侧链起着螯合 金属离子的作用,防止在
其煮沸过程中
DNA
的降解,在高温低离子强度下也起着催化
DNA
释放的作用。在
Chelex
中加入蛋白酶
K
,有助于口
腔上皮细胞的消化。

操作步骤

1
、取
3
×
3mm2
唾液斑样 品(过滤嘴纸质外层、唾液斑转移纱线)或剪取牙刷刷毛
1
束,放入
0.5ml
的离心管中,加入
0.5ml
纯水,振荡混匀,室温浸泡
15-30
分钟。

2

13,000rpm
离心
3
分钟,去除上清液,保留载体。

3
、加入
100
μ
l 5% Chelex-100
溶液和
5
μ
l 2mg/ml
蛋白酶
K

56°
C
保温
2
小时以上,

振荡
5-10
秒。

4
、沸水中煮
8
分钟(或在热循环仪上
100°
C
保温
8
分钟),振荡
5-10
秒。

5


13,000rpm
离心
3
分钟,

C
保存备用。

注意事项:

1
、多枚烟蒂应分别放入不同纸袋内送检,标明商标和提取地点。

2
、口腔拭子应在室温下自然晾干,放纸袋内送检。

3
、饮料罐、 水杯口上的唾液斑可分两步提取转移,先用湿棉签或纱布擦拭,再用干棉签或纱布擦拭,一并放入离心
管 中提取
DNA
。擦拭时尽量少用载体。

4
、对于量少的检材可不经水洗,直接加入
5% Chelex-100
溶液和蛋白酶
K
保温。


Chelex
法提取组织
DNA
适用范围:

人体的各种器官组织如心脏、脑、肌肉、软骨及毛根等。

原理:

Chelex
是由苯乙烯与二乙烯苯的共聚体组成的螯合树脂,其亚氨基二乙酸侧链起着螯合 金属离子的作用,防止在
其煮沸过程中
DNA
的降解,
在高温低离子强度下也起着催化
DNA
释放的作用。

5%

Chelex-100
中加入蛋白酶
K

液,有助于组织细胞的消化和
DNA
释放。

操作步骤

1
、剪取组织约
1mg
,放入
0.5ml
的离心管中,加入
200
μ
l 5% Chelex-100
溶液和
10
μ
l

2mg/ml
蛋白酶
K
;剪单根
毛发的毛根,加入
50
μ
l 5% Chelex-100
溶液和
5
μ
l 2mg/ml
的蛋白酶
K

56?
C
保温
2
小时以上,振荡
5-10
秒。

2
、沸水中煮
8
分钟(或在热循环仪上
100?
C
保温
8
分钟),振荡
5-10
秒。

3

13,000rpm
离心
3
分钟,
4?
C
保存备用。

注意事项

1
、焚烧的尸体应取深层肌肉,严重腐烂尸体应提取软骨。

2
、多根毛发的毛根应分别提取
DNA


3
、带毛根的毛发干燥状态下保存送检,组织应冷冻保存送检。

4
、组织
DNA
含量较大,取材时不要过量。

5
、若组织表面较脏,应先用纯水冲洗,去除烟尘、泥土等杂质。

6
、毛根表面若粘有血迹或其他斑迹,应先用脱脂棉蘸纯水擦拭干净。


Chelex
法提取指(趾)甲
DNA
适用范围

该方法适用于人类指(趾)甲。

原理

指(趾)甲的主要成份为< br>α
-
角蛋白,也含有人体细胞。在二硫代苏糖醇(
DTT
)存在的条件 下,蛋白酶
K
可将
α
-
角蛋
白水解,在高温下破坏细胞内 的膜结构,释放出细胞内的线粒体
DNA
、核
DNA


对检材的条件要求

样品表面清洁,面积在
5mm2
以上。

操作步骤

1
、清洁指(趾)甲的表面:先用洗涤剂或去污剂的稀释溶液擦洗 指(趾)甲的表面,然后用手术刀片再刮

去一层表面,最后用纯水清洗,取出后用滤纸压干。

2
、将适量指(趾)甲样品剪为碎片,转移至
0.5ml
的离心管中,加入100?l
5%Chelex
-100
溶液,10?l
4M
DTT 溶
液,10?l 5mg/ml 蛋白酶
K
溶液,混匀,56°C 保温
4
小时以上。

3
、沸水中煮
8
分钟(或在热循环仪上
100?
C
保温
8
分钟),振荡
5-10
秒。

4

13,000 rpm
离心
5
分钟,4°C 保存备用。

注意事项

1
、对于一些难于酶解的检材可以适时、适量补加蛋白酶
K

2

Chelex
法提取后的检材,可使用
Promega
公司 的
DNA IQ
系统进行纯化,浓缩。








Chelex-100
法提取混合斑中女性
DNA

适用范围

该方法适用于混合斑中女性
DNA
的提取。

原理

在没有
DTT
存在的情况下,
混合斑中的精子不会裂解释放出
DNA


Chelex-100< br>法提取到的混合斑中
DNA
主要为
女性
DNA


操作步骤

1
、取

3mm2
混合斑检材放入< br>0.5ml
的离心管中,加入
200
μ
l 5% Chelex-100
溶液和
10
μ
l 2mg/ml
蛋白酶
K

56?
C


1
小时以上,振荡
5-10
秒。

2

13,000rpm
离心
3
分钟,吸取上清液至
0.5ml

的离心管中,沸水中煮
8
分钟(或在热循环仪上
100?
C
保温
8

钟),振荡
5-10
秒。

3

13,000rpm
离心
3
分钟,
4?
C
保存备用。

注意事项

1
、通常
STR
检验分型结果为单一的女性基因型,男性谱带的峰值很低,与背景噪音相当。

2
、特殊情形下,如混合斑中若混有男性血或含有大量男性上皮细胞等,则
STR
分型为混合谱带。


Chelex
法提取混合斑中精子
DNA
适用范围

该方法适用于阴道拭子和各种载体上含有精子的混合斑。

原理

利 用女性上皮细胞与精子结构上的差异,
首先在蛋白酶
K

SDS
作用 下裂解上皮细胞,
分离去除上清
(
女性
DNA)

保留沉淀
(
精子的头部
)
,漂洗去除残留的女性
DNA
;在
DTT
、蛋白酶
K

Chelex(
螯合树脂,防止煮沸过程中DNA

降解
)
存在的情况下,进行二次消化,释放出精子
DN A


操作步骤

1
、将带有精子的检材约
2cm
剪碎,装入
1.5ml
离心管
A
中,

lml T NE
溶液或去离子水,
37
℃浸泡
30
分钟。
〔可
13000rpm
离心
3
分钟,后取
100
ul
上清溶液 做抗人前列腺特异抗原(
PSA
)金标试剂条检验,再在
A
管中补加
100
ul

TNE
,振荡〕然后加入
10%SDS
(约
100 ul
)至终浓度
1%
,加蛋白酶
K
(约
10 ul
)至终浓度
100ug/ml

37
℃保温
2
小时以上(时 间长些效果会更好,因而可过夜)


2
、套管离心(将
A
管底部用针穿一个洞,套在另一个管
B
中)

13000rpm
离心
5
分钟(或可用
5000rpm
离心
10
分钟、或可用10000rpm
离心
8
分钟)
,弃
A
管。

3
、弃
B
管中上清液,沉淀物加入
1mlTNE
溶液或去离 子水振荡重悬,
13000rpm
离心
5
分钟离心,弃上清液;如
此 反复漂洗一至五次,后
B
管中保留
20-30
ul
的液量做精子< br>DNA
提取。
(沉淀物可保留一半以备女性物质去除不净时
再次进行消化。

4
、沉淀物中加入
200ul 5%Chelex-l00
溶液、
20ul 10mg/ml
蛋白酶
K

10ul 1MDTT

56

30
分钟至
4
小时(或过
夜)


5
、振荡
5-10
秒,
98

8-10
分钟,振荡
5-10
秒。

6

1300 0rpm
离心
3
分钟,
4
℃或
-20
℃保存备用。

注意事项

1
、检材用量不要过大,以利于充分浸泡、消化,并避 免
DNA
模板浓度过高,导致小片段优势扩增。

2
、女性物质过多 时,可延长第一步消化时间,增加漂洗次数
;
或将保留的一半沉淀物再次进行消化。

3
、遇有抑制物干扰时,可通过稀释或用
DNAIQ
系统纯化模板
D NA
来解决。


2
DNA IQ
系统纯化
DNA
适用范围

该方法适用于
DNA
的纯化。

原理

本方法运用
DNA
IQ
系统,对有机法和
Chelex-100
法提取的
DNA
进行纯化。在高浓度
chaotropic
salt

NaI、硫氰
酸胍和盐酸胍等)存在的条件下,核酸吸附到二氧化硅上,而在低盐条件下被洗脱下来。
操作步骤

1
、剪取适量检材于
1.5ml
离心管中 ,加
200ul
配制好的裂解液(
100ul
裂解液
+1ul 1M DTT
),
95
℃保温
30
分钟;

2
、 套管离心,去掉载体,将上清液转移至另一个
1.5ml
的离心管;

3、离心管中加入
2
倍体积配制好的裂解液和
7ul
树脂,漩涡振荡使树脂 悬浮,室温放置
5
分钟,期间震荡
3-5
次,以
使树脂保持悬浮;< br>
4
、旋涡振荡后将离心管置于磁架上,小心弃去液体;

5
、加
100ul
配制好的裂解液,旋涡振荡使树脂悬浮,将离心管放在磁力架上,小心弃去液体 ;

6
、加
100ul
配制好的
1
х
洗液 (
2
х
洗液:无水乙醇:异丙醇
=2

1

1
),旋涡振荡使树脂充分悬浮,将离心管放在
磁力架上,小心弃去液体;

7
、重复三次步骤
7
,最后一次尽量将上清液吸干净;

8
、打开离心管盖子,室温下空气干燥
5
分钟;

9
、加入
50ul
纯水,旋涡振荡使树脂悬浮,离心管放在加热块上,
65
℃ 保温
5
分钟,期间振荡
3-5

;
10
、取出离 心管,旋涡振荡使树脂悬浮后,立即将离心管置于磁力架上,小心将
DNA
溶液吸出至干净管中 备用;

注意事项

1
、待纯化的样品在加入裂解液后仍呈粘稠状, 会影响磁铁架吸附树脂,导致离心管放入磁架后树脂不贴壁,仍呈
悬浮状,此时应用裂解液进一步稀释, 或步可将样品在
56
℃加热
1
分钟,溶液即可澄清;



2
、每步应尽量吸净液体。

3
、旋涡振荡充分,使树脂在每次洗涤中不发生凝结。

4
、干燥时间不要超过
20
分钟。

5
、低温洗脱导致回收率低,洗脱时应置
65o
保温
5
分钟。

6

7
μ
l
树脂只能吸附约
100ng DNA
,因此无需加入过多的
DNA



Micoron 100
柱纯化方法

1
、分别标记两个编号一样的
1.5ml
管×(
A
管、
B
管);

2
、将已用
C HELEX100
法或有机法等已制备好的
DNA

13000rpm
离心
3
分钟;

3
、将
micoron
100
柱放在离心管
A
上,往柱子里加适量已制备的
DNA
(约
3 0-50ul
即可),再往柱子里加
100ul
去离子
水,盖上盖子;

4
、将离心管
A
(套有柱子)
1000rpm
离心5-10
分钟(柱子内约保留
20-30
ul
的溶液)


5
、从离心管
A
上拆下
micoron-100
柱(弃
A
管),将
micoron-100
柱翻转后放在离心管
B
上,盖上盖子;

6
、将离心管
B
(套有柱子)
13000 rpm
离心
5
分钟;

7
、弃柱子,收集的
DNA
溶液保留在离心管
B
中备用。








抗人血红蛋白(
anti- Hb
)金标试剂条检验人血液(斑)

适用范围

该方法适用于疑含有人血的所有检材。

原理

抗人血红蛋白金标试 剂条检验人血的基本原理是双抗体夹心法。
吸附于试剂条加样区的金标记单克隆抗人
Hb 抗体
与含有人血的检材(样本)浸泡液反应后,形成金标记抗体抗原复合物,并向试剂条吸附区扩散 ,当扩散至试剂条预粘
附有线性未标记的单克隆抗人
Hb
处时,
与未标记的单克隆抗人
Hb
反应,
并沉淀于该处,
形成紫红色沉淀带
(检测线)

如果检材(样本)浸泡液中无
Hb
则不能形成紫红色沉淀带。吸附于试剂条加样区的多余金标记单克隆抗人
Hb
抗体越
过检测线,继续向试剂条吸附区扩散,当扩散至试剂条预粘附有线性标记的羊抗鼠
IgG
处时,形成紫红色沉淀带(质
控线)。

对检材的条件要求

人血稀释
8
万倍以下或人
Hb
含量
1000ng/ml
以上。

操作步骤

剪取适量大小疑含有人血斑检材或吸取适量疑含有人血液检材,于
0.5ml
离心管内,加入
450
μ
l
纯水,室温放置
30
分钟,不时振荡,
13,000rpm

5
分钟,移上清于另一
0.5ml
离心管内,将试剂条带
MAX
标记一端插入上清中,室
温静置
5
分钟,观察结果。

结果

阳性
:
阳性二条带,质控线及检测线均为阳性。

加样区

反应区

吸附区


检测线

质控线

阴性一条带,仅有质控线。

注意事项

1
、视检材情况确定检材取量、纯水用量及浸泡时间。一般检材室温浸泡
30
分钟,陈旧检材可
4
℃浸泡过夜。

2
、试剂条应置于检材浸泡离心上清液内(不应超过
MAX
线)
5
分钟内观察结果。

3
、试剂条质控线阳性时结果判断才有效。

4
、假阴性的原因包括检材太浓而表现为前滞作用或试剂条灵敏度低等。

5
、假阳性的原因包括抗体的非特异性反应或试剂条反应后久置等。

6
、试剂条应在室温干燥条件下保存,在有效期内使用。













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