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PCR
扩增及
DNA
琼脂糖凝胶电泳
刘琳
1131428
环境科学
一、实验目的
1
.学习并掌握
PCR
扩增的基本原理与实验技术。
2
.对扩增后的
DNA
进行琼脂糖凝胶电泳试验,并分析相应结果。
二、实验原理
1. PCR
扩增
多聚酶链反应
(
PCR
)
技术的原理类似于
DNA
的天然复制过程。
在微 量离心管中加入
适量缓冲液,加入微量模板
DNA
、四种脱氧核苷酸(
dNT P
)
、耐热
T
aq
聚合酶及两个合成
DNA
的引物 ,而后加热使模板
DNA
在高温下(
94
℃)变性,双链解链,这是所谓变性 阶
段。降低溶液温度,使合成引物在低温(
55
℃)与模板
DNA
互 补退火形成部分双链,这是
所谓退火阶段。溶液反应温度升至中温(
72
℃)
,在
Tap
酶作用下,用四种
dNTP
为原料,
引物为复制起点,< br>模板
DNA
的一条双链在解链和退火之后延伸为两条双链,
这是延伸阶段。如此反复,在同一反应体系中可重复高温变性、低温退火和
DNA
合成这一循环,使产物< br>DNA
重复合成,并在重复过程中,前一循环的产物
DNA
可作为后一循环的模 板
DNA
而参
与
DNA
的合成,使产物
DNA
的量 按指数方式扩增。经过
30
~
40
个循环,
DNA
扩增即可
完成。
2. DNA
琼脂糖凝胶电泳实验
DNA
分子在高于其等电点的溶液中带负电,在电场中向阳极移动。在一定的电场强度
下,
DNA< br>分子的迁移速度取决于分子筛效应,
即分子本身的大小和构型是主要的影响因素。
DNA
分子的迁移速度与其相对分子量成反比。
不同构型的
DNA
分子的迁移速度不 同。
该电
泳方法以琼脂凝胶作为支持物,利用
DNA
分子在泳动时的电荷效应 和分子筛效应,达到分
离混合物的目的。
三、实验材料
仪器:< br>PCR
扩增仪、
0.2ul
薄壁管、
1.5ml
离心管、移液 枪、枪头、微波炉、电泳仪、
水平电泳槽、制胶版、紫外透射仪。
试剂:
TapDNA
聚合酶、
dNTP
、
buffer
、
两种引物、
16S
全长
DNA
样本、
无菌
ddH
2
O
、
模板
DNA
、
TBE
、琼脂糖、
EB
、显色剂。
四、
实验步骤
1. PCR
扩增
本次试验选择细菌
16S rDNA V3
区片段进行扩增。
1.1
根据计算,首先取
1.5ml
离心管按照
2.5ul 10
×
Buffer
、
1 ul
dNTP
、
0.5 ul 341GC
、
0.5 ul 534
、
0.125 ul Taq
、
19.375u ddH
2
O
的比例配置足量的
PCR
反应体系。
1.2
分别向
9
个薄壁管中分别加入
24 ul
的反应体 系,并分别添加
8
种不同的模版,并于第
9
个薄壁管中加入无菌
dd H
2
O
作为阴性对照。
1.3
将薄壁管放入
P CR
扩增仪中,按照预定程序进行
PCR
扩增。其中循环过程需要达到
30~ 40
次。程序如下:
预变性:
94
℃
3min
循环:
94
℃
变性
30s
55
℃
退火
30s
72
℃
延伸
30s
末次延伸:
72
℃
5min
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