全日康中频治疗仪-龙岗区人民医院
一、
实验名称:
重组
DNA
技术
二、
实验目的
:
1.
了解掌握
DNA
重组技术理论基础;
2.
掌握质粒载体、外源
DNA
的准备、酶切、连接技术方法;
3.
掌握连接产物的转化方法及操作;
4.
掌握阳性重组体的的鉴定和筛选方法;
三、实验原理
:
1.
重组
DNA
技术
重组
DNA技术是指
在体外通过人工
“
剪切
”
和
“
拼接< br>”
等方法,对各种生物的
核酸(基因)进行改造和重新组合,然后导入微生物或真核细胞 内,使重组基因
在细胞内表达,
产生出人类需要的基因产物,
或者改造、
创造 新特性的生物类型
的技术。
它主要包括以下几个步骤:
①目的基因的获取: 主要有化学合成、
PCR
、基因组文库、
cDNA
文库构建
等。cDNA
文库是以
mRNA
为模板,利用反转录酶合成与
mRNA
互补的
DNA
,
再复制成双链
cDNA
片段,
与适当载体 连接后转入受体菌,
这些受体菌包含了所
有
cDNA
信息,总称
cD NA
文库
。常用于筛选编码蛋白质的结构基因。基因组
DNA
文库 是利用限制性核酸内切酶将组织或细胞染色体
DNA
切割后,
与适当载
体连接 后转入受体菌,这些受体菌包含了所有基因组
DNA
信息,因此称为基因
组
D NA
文库。
②基因载体的选择与构建:常用载体有质粒、噬菌体、病毒
DN A
等。分为
克隆载体和表达载体。克隆载体:用于目的基因的克隆、扩增、序列分析和体外定点突变等。
表达载体:
用于在宿主细胞中表达外源目的基因,
获得大量表达产< br>物。选择好的载体与目的基因利用限制性内切酶切割成合适片段。
③目的基因与载体的 拼接:通过粘性末端连接法(同源互补粘性末端连接、
非同源互补粘性末端连接)、平端连接、人工接头 连接、同聚物接尾、经部分补
平的不匹配末端的连接等将目的基因与载体进行连接。
④重组
DNA
分子导入受体细胞:
将连接有目的
DNA
的载体导入宿 主细胞,
主要有以下几种方法:
a
、转化:将质粒或其它外源
DNA
导入宿主细胞
(
常用大
肠杆菌
)
,并使其获得新的表型的过程。b
、转染:将外源
DNA
导入真核细胞的
过程。
c
、感 染:以
λ
噬菌体、柯斯质粒和病毒为载体的重组
DNA
分子,在体外
经过包装成具有感染能力的病毒或噬菌体颗粒,
才能感染适当的细胞,
并在细胞
内扩增 。
⑤重组体的筛选:
可通过遗传标记如抗药性标志选择、
营养缺陷型的互补 筛
选法及分子标记(
PCR
、分子杂交)等直接筛选或是根据免疫化学法、酶联免疫< br>检测法等进行间接筛选。
⑥无性繁殖转化子
(
含重组分子的受体细胞
)
⑦目的基因的表达
2
、质粒酶切及鉴定原理
限制性内切 酶是一种工具酶,其特点是具有能够识别双链
DNA
分子上的特
异核苷酸序列的能力, 能在这个特异性核苷酸序列内,切断
DNA
双链,形成一
定长度的
DNA序列。根据限制性内切酶的识别切割特性、催化条件及是否具有
修饰酶活性可分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三类,
II
型限制性内切酶只需要二价镁离子的激
活,
酶在其识别序列内 切割双链
DNA
,
产生的各种
DNA
片段具有相同的末端结
构,而且大多数的
II
型酶可提供粘性未端,有利于片段再连接,限制性内切酶
对环状 质粒
DNA
产生的酶切片段数与切口数一致。因此,鉴定酶切后的片段在
电泳凝胶的区 带数,
就可以推断切口的数目
;
从片段迁移率可判断酶切片段大小。
用已知分 子量的线状
DNA
为对照,通过电泳迁移率的比较,可以粗略地测出分
子形状相同的未 知
DNA
的相对分子大小。
本实验采用的限制性内切酶是
Bam HI
和
Hind III
。
对于
DNA
回收,回收的目的是为了纯化提取的质粒,以用于以后的分子
杂交、重组质粒的构建、序列分析等。目 前常用的回收技术有:柱纯化回收法、
电洗脱法、低熔点琼脂糖凝胶法、
DEAE
滤膜 插片法等,其中柱纯化回收法、电
洗脱法,
经济节省,
操作方便,
对
DNA
回收效果好。
本实验采用试剂盒回收
(柱
纯化回收法)
,其原理是采用凝胶裂解液融化凝胶,
采用特殊的收集管收集
DNA
后,漂洗液洗脱 杂质,最后用洗脱液洗出
DNA
。
四、主要实验仪器
:
不同规格移液器、
EP
管、常规电泳仪、紫外灯、恒温水
浴箱、常规台式离心 机、恒温孵箱、
CP3
吸附柱、收集管、培养皿、酒精灯、玻
璃涂布棒等。
五、主要实验试剂
:
1.
酶切相关试剂:
p UC18DNA
、
λDNA
(
TIANGEN, MD202
)
、
Hind III
(
Thermo,
ER0501
)、
Buffer R (10X)
(
Thermo, BR5
)、
BamHI
(
Thermo, ER0051
)、
BamHI-Lsp1109I Buffer (10X)
(
Thermo, B57
)
、
pUC18-mir203
质粒
DNA
(老
师提供)。
2.
电泳相关试剂:
琼脂糖、
GoldView
、
1kb DNA Ladder
(
TIANGEN
,
MD111
)
、
DNA
电泳
loading buffer
(
6X
)(
TIANGEN, RT201-01
),电泳缓冲液。
3
、
凝胶
DNA回收:
小量琼脂糖凝胶
DNA
回收试剂盒
(庄盟国际生物,
ZP 202
)
。
4.
重组体构建相关试剂:
T4
DNA
连接酶
(Thermo,
EL0014)
、
10X
T4
DNA
连接
buffer( Fermentas, 00044933)
。
5.
转化相关试剂:
感受态细胞(本实验 用感受态细胞
DH5
α
从公司购买)、
LB
培养基(老师提供)、含
Amp
琼脂糖平皿(老师提供)、质粒小量提取试剂
盒(庄盟国际生物,
ZP 101
)、
ddH
2
O
等。
六、实验步骤
:
1.
载体
pUC18
和目的
DNA
酶切
(
1
)质粒
DNA
酶切反应体系:
试剂
pUC18DNA (5ug)
10
×
buffer
Hind
Ⅲ
(15U)
ddH
2
O
total
体积
(ul)
2.5
2
5
10.5
20
反应条件:
37
℃恒温水浴,
2hr
;室温下放置等待连接。
(
2
)目的
DNA
酶切反应体系:
试剂
λDNA(5ug)
10
×
buffer
Hind III(9U)
ddH
2
O
total
反应条件:
37
℃恒温水浴,
2hr
;
体积
(ul)
10
2
3
5
20
(
3
)质粒载体双酶切反应体系:
试剂
pUC18-mir203
质粒
DNA(4
μ
g)
10
×
buffer
Hind III(9U)
Bam HI
ddH
2
O
total
反应条件:
37
℃恒温水浴,
2hr
;
根据以上反应体系配制好后,瞬时离心后置于
37
℃恒温水浴锅中反应。
体积
(ul)
25
5
2
1
17
50
2.
目的
DNA
酶切片段电泳鉴定
(
1
)
配制
1%
琼脂糖凝胶:
称取
0.5
克琼脂糖,置于锥形瓶内 ,加入
50ml
1
×
TAE
,瓶口用保鲜膜封盖,在微波炉中加热 直至琼脂糖全部溶解,得到
1
%
琼脂糖凝胶液,待其冷却至
65
℃左右,加入
2.5
μ
L
GoldView
。小心混匀并倒在
制胶槽中,控制灌胶速度 ,使胶液缓慢展开,避免产生气泡,待胶凝固完全后,
轻轻拔出梳子。将凝胶放入电泳槽中,加入恰好没 过胶面
1mm
深的足够电泳缓
冲液,准备电泳。
(
2
)
电泳:
取
20uL
酶切后产物,加入
4uL
DNA
电泳
loading
buffer
混匀,
上样20uL
。
恒压
90V
电泳
40-60min
。
(
3
)
紫外灯下观察结果并切胶用于后续试验。
3.
目的
DNA
凝胶条带切割及目的
DNA
回收
根据试剂盒说明书操作
(
1
)将单一的目的
DNA
条带从琼脂糖凝胶中切下(尽量切除多余部分)放入
干净的离心管中,称取重 量,约
0.3g
。
(
2
)向胶块中加入
3
倍体积溶胶液(
900
?
l
),
55
℃
,
水浴
10
分钟左右,其间 不
断温和地上下翻转离心管,以确保胶块充分溶解。
(
3
)
将上一步所得溶液加入一个吸附柱中
(吸附柱放入收集管中)
,
12,000 rpm
(~13,400
×
g )
离心
1
分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放入收集管中。
(
4
)
向吸附柱中加入
600
μ
l
漂洗液
W2
(使用前加入无水乙醇)
,
12,000 rpm
(~13,400
×
g )
离心
1
分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放入收集管中。
(
5
)向吸附柱中加入
500
μ
l
漂洗液
W2
,
12,000 rpm (~13,400
×
g )
离心
1
分
钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放入收集管中。
(
6
)将吸附柱放入收集管中,
12,000 rpm (~13,400
×
g )
离心
2
分钟,尽量除去
漂洗液。将吸附柱置于室温放置数分钟,彻底晾干。
(
7
)将吸附柱放入一个干净离心管中,向吸附膜中间位置悬空滴加
50
μ
l
的洗
脱缓冲液
TE
,
12,000 rpm (~13,400
×
g )
离心
1
分钟,收集
DNA
溶液。
4.
连接目的
DNA
和酶切后的质粒
DNA
反应体系:
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