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四川大学实验报告
题目:
植物基因组
DNA
的提取与检测
一、实验目的
1.
了解真核生物基因组
DNA
提取的一般原理;
2.
掌握基因组
DNA
提取的方法和步骤。
二、实验原理
1.
在液氮中对植物组织进行研磨,破碎细胞;
< br>
等离子型表面活性剂能溶解膜蛋白而破坏细胞膜,使核蛋白解聚,从而使
DNA
游
离出来;
3.
苯酚和氯仿等有机溶剂能使蛋白质变性,并使抽提液分相, 因核酸水溶性很强,经离
心后即可从抽提液中除去细胞碎片和大部分蛋白质;
4.< br>上清液中加入异丙醇使
DNA
沉淀,沉淀
DNA
溶于
TE缓冲液中,即得植物基因组
DNA
溶;
的琼脂糖凝胶电泳鉴定 :带电荷的物质,在电场中的趋向运动称为电泳。
DNA
的
琼脂糖凝胶电泳可以分离长 度为
200bp
至近
50kb
的
DNA
分子。
DN A
的迁移率(
U
)的对
数与凝胶浓度(
T
)之间存在反平行 线性关系。因此,要有效地分离不同大小的
DNA
片
段,选用适当的琼脂糖凝胶浓度是 非常重要的。
三、实验材料
1.
设备
移液器,台式高速离心机,水浴锅,陶瓷研钵,
1.5ml
离心管
2.
材料
植物幼嫩叶片
3.
试剂
(
1
)细胞提取液:
100mmol/L
Tris-HCl,
pH8.0,
5mmol/L
EDTA,
500mmol/L
NaCl,
1.25%
SDS
,
1%
β
-
巯基乙醇(去除酚类)
(
2
)氯仿
:
异戊醇(
24:1
)
(
3
)其它试剂:液氮、无水乙醇、
TE
缓冲液、异丙醇、洗涤缓冲液
四、方法和步骤
1
、 取
500
μ
L
细胞提取液于
65
0
C
水浴 (金属浴)中加热备用;
2
、研钵用液氮预冷,新鲜植物叶片(自来水清洗,蒸馏水 冲洗干),去除叶脉,剪成
细条状,置于研钵中研磨成粉末状(越细越好);
3、取
0.1g
粉末(大约两勺半)转移至
500
μ
L
预 热的细胞提取液中,迅速摇匀,
65
0
C
水浴(金属浴)中保温
30 min
,
10min
左右温和颠倒混匀一次;
第
1
页
四川大学实验报告
题目:
植物基因组
DNA
的提取与检测
4
、从水 浴(金属浴)中取出离心管,加等体积
(
约
500
μ
L)
氯 仿
/
异戊醇(
24:1
),室温
下
10000rpm
×
10min
;
5.
将上清液转移到另一
1.5mL< br>离心管中(使用的枪头用剪刀剪成大口),加等
2/3
体积
的异丙醇,轻轻混匀 ,静置
1min,
使核酸沉淀下来,
12000r/min
×
5min
,倒掉上清液;
6
、
加入
1ml
洗涤缓 冲液,
轻轻转动离心管使核酸沉淀悬浮起来,
静置
5min,12000r/min< br>×
2min,
去除上清液,再加入
1ml
洗涤缓冲液,轻轻转动离心 管使核酸沉淀悬浮起来,
放置
5min;
7
、
12000r/min
×
10min
后,倒去上清液,用小滤纸条将管壁上多余的水分吸掉,室温
静置干燥;
8
、干燥后,加入
20
μ
LTE
缓冲液,溶解
DN A
,做好标记;
9
、取
5
μ
L
溶液,< br>0.7%
琼脂糖凝胶电泳检测
DNA
大小和质量。
MarkerDNA
为
DL15000
。
五、注意事项
(一)提取
DNA
的过程:
的二级结构和双链易受多种因 素(如强酸、强碱、加热、低盐浓度、有机溶剂、
酰胺类、尿素等)的影响引起双链解开,
即“ 变性”
,因此抽提时避免使用变性的条件;
2.
抑制内外源
Dna se
的活力。
Dnase
就像一把刀,它能把大分子的
DNA
切成碎 片,所以
要加以杜绝,现可以通过多种途径来做到这一点:
a.
低温操作;
b .
调节
pH,
使偏碱
(
pH8.0);c.
抽提液中加表明 活性剂;
d.
加螯合剂(
EDTA
)除去酶的辅助因子(
Mg
2+
)
,
使酶活性丧失;
3.
防止物理因素降解。如温 度太高或机械张力剪切等,
DNA
分子特别大,极易被机械张
力拉断,甚至在细管中稍 急一些的流动也会使
DNA
断裂,所以在抽提过程中要特别注意
这一点,操作过程要尽 量简便、温和、减少搅拌次数,也不要剧烈摇动;
4.
植物的次生代谢物
( 主要是胞质内的多酚类或色素类化合物)
对核酸提取有干扰作用。
因此,一般进可能选幼嫩的、 代谢旺盛的新生组织作为提取
DNA
的材料,这是因为幼嫩
的新生组织次生代谢物较少 ,
DNA
含量高,切易于破碎,植物材料最好是新鲜的。
(二)琼脂糖凝胶电泳检测基因组
DNA
:
为诱变剂、致癌物,接触凝胶必须戴手套操作;
2.
将溶液加入样品槽时,勿划破或戳破加样孔,勿带入气泡;
3.
紫外线对眼睛有害,将胶块置于紫外灯下观察时,带上防护镜或眼睛,或隔着玻璃或
有机玻璃观察。< br>
六、实验结果与分析
1.
植物基因组
DNA
提取结果:
第
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