-
基因工程与分子生物学重点
1
.限制性核酸内切酶:凡是识别切割双链的< br>DNA
分子内特定核苷酸序列的酶称为限制性
核酸内切酶,简称为限制性酶。
2
.限制性核酸内切酶的一般性质:
37
℃
,
pH
为
7.2~7.6
,用
Tris
—
HCl
,
Gly
—
NaOH
两种缓
冲液,
Mg2+Buffer
,
5mM
,盐浓度,巯基试剂:
β
-ME
,
DTT
,
BSA
(牛血清白蛋白,稳定
酶的作用)
;决定生产的特定的
DNA
片段的大小,识别顺序具有
180°
的旋转对称,识别顺
序一般是
4~6个碱基,也有
6
个以上的,但是没有
4
个以下的,产生三种不同的切口< br>:
形成
平头末端(
Smal
Ⅰ
)
:连接困难,效率较 低;形成
5’
粘性末端(
EcoR
Ⅰ
)
:相对而言,
5’
突出
尾,
3’
凹末端;形成
3’
粘性末端(
Pst
Ⅰ
)相对而言,
3’
突出尾,
5’
凹末端。
3
.星活性:在非标准条件下(低盐和高
pH
,高甘油浓度
>5%< br>)
,限制酶识别顺序与切割顺
序发生改变的现象。
4
.大肠 杆菌
DNA
聚合酶
I
大片段(
Klenow
片段)
:将
Pol1
切下一个小片段失去
5’
到
3’
外
切 酶活性。补平限制酶切割
DNA
产生
3’
凹槽(
5’
到3’
合成)
,用
[32p]dNTP
补平
3’
凹端,< br>对
DNA
片段进行末端标记,
对带
3’
突出端的
DN A
进行末端标记
(利用置换活性)
,
在
cDNA
克隆中,用 对和陈那个
cDNA
的第二条链,在体外诱变中用于从单链模版合成双链
DNA
,
应用
Sanger
双脱氧末端终止法进行
DNA
测序,消化限制 酶产生的
3’
突出端,应用于
PCR
技术。
5
. 基因工程的工具酶:
T7
噬菌体
DNA
聚合酶,修饰的
T7
噬菌体
DNA
聚合酶,
TaqDNA
聚合酶(没有校正功能)
,大肠 杆菌
DNA
聚合酶Ⅰ
,大肠杆菌
DNA
聚合酶Ⅰ
大片段,< br>T4
噬
菌体
DNA
聚合酶。
6
.末端转移 酶:将相同的核苷酸依次连接到
3’
末端,然后两条
DNA
通过同源多聚尾巴 连
接在一起,在表达前将
ploy(G)
切除,否则影响蛋白质的生物活性。
7
.
T4
噬菌体多核苷酸激酶:使
DNA
的
5’< br>端磷酸化,也可以使
DNA
的
5’
端去磷酸化。可
以发生正向 反应,也可发生交换反应。正向反应:
5’CTGCAG
在酶和
ATP
(ATP
具有
α
,
β
,
γ
磷酸基团,其中
γ
可给出)的作用下,生成
5’pCTGCAG
;交换反应:
5’pCTG ACG
在酶和
ADP
的共同作用下,去磷酸化,将
DNA
链上的磷酸 基团给出,生成
5’CTGCAG
和
ATP
,
在
酶和
被标记的
A
TP
作
用下
使得
DNA
再
次 被
磷酸
化同时
被标
记,生
成
ADP
和
5’ *pCTGCAG
。
8
.基因工程载体种类:质粒,噬菌体的衍生物,科斯 质粒或粘粒,噬菌体质粒,单链
DNA
噬菌体
M13
,真核病毒载体,酵母质 粒载体,杆状病毒。
9
.质粒:在细菌细胞内作为与宿主染色体有别的复制子而进行 复制,并且在细胞分裂时能
恒定传递给子代细胞的独立遗传因子。
10
.质 粒作为基因工程载体所必备的条件:
1
)具有较小的分子量和松弛的复制子,
2
)基因
组上有
1~2
个筛选标记,
便于在平板中区分重组体和非重组体,< br>3
)
DNA
链上有
1
到几个限
制酶的单一识别与切割 位点,便于外源
DNA
的插入,
4
)具有插入失活(或是插入表达)
的筛选标记,便于从平板中直接筛选阳性重组体。
11
.
Ti
质粒 :引起植物形成肿瘤
—
冠瘿瘤的质粒称为诱导肿瘤的质粒。
12
.
Ti
质粒的优点:宿主范围广泛,
Ti
质粒能过转化所有的双子叶植物,并将 外源基因导
入植物细胞;
整合到宿主细胞
ch
—
DNA
上的
T
—
DNA
成了染色体的正常遗传成分,
永远居
留,
代代相传;
T
—
DNA
上的
Opine
合成酶基因有一个 强大的启动子,
能启动外源基因在植
物细胞中高效表达。
13
.分 子杂交(杂交,
hybrdization
)
:核酸研究中一项最基本的实验技术,它 是指在一定条
件下互补核酸链复性形成双链的过程。
14
.分子杂交的原理 :
(
一
)DNA
的变性:指分子有稳定的双螺旋结构松解为无规则线性结构的现象,确切的说是维持双螺旋结果稳定的氢键和疏水键的断裂,
DNA
变性不涉及到其
一级结构的改变;
(二)
DNA
的复性:指变性的两条互补
DNA< br>链在适当条件下,全部或部
分恢复到天然双螺旋结果的现象,它是变形的一种逆转过程。热变性< br>DNA
一般经缓慢冷却
后便可复性,此过程称之为
“
退火
”< br>(
annealing
)
。
15
.
Sou thernblot
操作技术:
将获取得
DNA
样品进行琼脂凝胶电泳,将琼脂糖凝胶上的
DNA
片段按原有的顺序转移到一张硝酸纤维素薄膜上并固定下来,用< br>32P
标记的
DNA
或
RNA
探针与之杂交,用发射自显影技 术确定任何能与探针
DNA
或
RNA
杂交的带。
16.
Northernblot
操作技术:
将获取得
RNA
样品进 行琼脂糖凝胶变性电泳,
将琼脂糖凝胶上
的
RNA
按原有顺序转移到一张硝酸 纤维素薄膜上并固定下来,
用
32P
标记的
DNA
或
RNA
探针与之杂交,用发射自显影技术确定任何能与探针
DNA
或
RNA
杂交的带。
17
.
Westernblot
操作技术:将获取得蛋 白质样品进行聚丙烯凝胶电泳,将聚丙酰胺凝胶上
的蛋白质带按原有顺序转移到一张硝酸纤维素薄膜上并 固定下来,
用
32P
标记的
DNA
或酶
标记的蛋白质探针与 之杂交,
用发射自显影技术确定任何能与探针
DNA
或
RNA
杂交的 带。
18
.原位杂交:转为鉴别阳性重组体而设计的
DNA
杂交法 ,若受体
DNA
是从转化的菌落
释放,则原位杂交又称菌落杂交,若受体
DN A
从转染的空斑释放,则称空斑杂交。基本程
序:在硝酸纤维素薄膜上接种转化细胞长出菌落( 或空斑)并溶解释放
DNA
通过变性和干
燥,使
DNA
在原有位置固 定,作为杂交的受体
DNA
,以后的杂交和放射自显影与前两种
方法基本相同,
原位杂交是鉴别阳性重组体的精确和快速方法,
一张硝酸纤维薄膜上筛选的
菌落可达到上百个 。
19
.探针标记:放射性标记:大肠杆菌
DNA
聚合酶
IKlenow
片段标记合成的寡核苷酸,达
成杆菌
DNA
聚合酶
I
标记寡核苷酸探针,
T4DNA
聚合酶标记寡核苷酸探针,
末端转移酶标记寡核苷酸探针,
T4
噬菌体多核苷酸激酶标记寡核苷酸探针;体内标记:生物体的新陈代
谢,食物、营养来源标记探针,非放射性标记(成本高,污染小)
:
地高辛,化学发光 素。
20
.分子克隆:讲一个基因片段插入到另一个载体
DNA
中 ,组成重组
DNA
分子,将它转
入到受体细胞中复制扩增,
即进行无性生殖,
由于这类克隆在分子水平上操作,
故称为分子
克隆。
21
.外源基因导入宿主细胞的方法:
1
)逆转录病毒感染法:产物用于食品,医药一般不采
用该方法,但在科研上效果好;
2
)
DNA
显微注射法:在显微镜下,用显 微镜将目的基因注
射入宿主细胞内,但对宿主细胞的机械损伤较大;
3
)磷酸钙转染技 术:磷酸钙反复转染,
是的
DNA
沉淀下来,
易接受外源
DNA;
DEAE
葡聚糖转染技术:
DEAE
葡聚糖与目的基因
共沉淀 ,易于细胞结合;
5
)聚阳离子
—
DMSO
转染技术:
DM SO
较强的去污剂,对宿主细
胞有机械损伤,转入宿主细胞内时间过长,机械损伤过大;
6
)电穿孔技术:电击,产生微
小孔洞使得目的基因转入,强度时间的控制很重要,防止致死 细胞;
7
)
原生质体融合技术:
充足
DNA
分子包裹在人工 膜
(脂质体转染)
内,
然后直至体育宿主细胞融合导入目的基因;
8
)精子载体介导法:局限性,与卵子结合,受精卵受精成熟的后,鉴定再哪个组织细胞中;
9
) 胚胎干细胞法:胚胎干细胞培养困难,增长传代系数。
22
.遗传选择标记:
1
)胸腺核苷酸基因(
tk
)
:验证生物活性,用
HAT
培养基(
H
次黄嘌
呤,
A
氨基嘌呤,
T
胸腺嘧啶核 苷)
;
2
)二氢叶酸还原酶基因(
dhfr
)
:二氢叶酸在 二氢叶酸
还原酶作用下还原成四氢叶酸,
dhfr
—
不能还原成四氢叶酸,使 得细胞死亡;
3
)氯霉素乙
酰转移酶基因(
cat
)
:氯霉 素乙酰转移酶将氯霉素乙酰化,是氯霉素失效,
cat
—
则不能是氯
霉素乙酰 化,细胞死亡;
4
)细胞的黄嘌呤鸟嘌呤磷酸核糖基转移酶基因(
ecogpt
)
;
5
)细
菌的新霉素磷酸转移酶基因(
econeo
)
。
1
.
哺乳动物基因转移中常用的报告基因:
1
)
人生长激素基因
(
hGH
,
humangowthhormone
)
;
2
)
碱酶基因
(
alkalinephosp hatase
)
;
3
)
半乳糖甘酶基因
(
Lacz
)
;
4
)
荧光素酶基因
(
luciferas)
;
5
)绿荧光蛋白基因(
GFP
,
Greenflu orescentprotein
)
;
6
)邻苯二酚
—
2< br>,
3
—
双加氧标志基因
(
CatO2aseCatechol :Oxygen2,3
—
oxidoreductase
)
2.植物基因工程常用的基因:
(一)抗植物病虫病基因:
1
)
Bt
基因(苏云金杆菌杀虫结晶
蛋白基因)
;
2
)昆虫的蛋白酶抑制剂基因:丝 氨酸蛋白酶抑制剂,巯基蛋白酶抑制剂,金属
蛋白酶抑制剂;
3
)植物凝集素基因(< br>lectingene
)
;
4
)淀粉酶抑制剂基因;
(二)抗 植物病
毒基因:
1
)
cp
基因(外援的病毒外壳蛋白基因)
;
2
)病毒复制酶基因;
3
)病毒卫星
RNA
的利用:卫星
RNA
是多核苷酸,他们有时在其相伴的病毒中被发现,它们按照相伴病毒的
复制和传 播机制,
从一个植株传到另一个植株,
它们不与其相伴病毒序列同源,
对病毒的复制也不起作用,但卫星
RNA
具有改变其相伴病毒的致病力的能力;
4
) 核糖体失活蛋白基
因:产物是核糖体失活,影响病毒蛋白质合成;
5
)干扰素基因;< br>6
)缺陷干扰颗粒
(
defectiveinterfering
,< br>DI
)指那些序列与亲本病毒相关的,但必须依赖于病毒才能复制的
DNA
分子 ,这种分子多存在于动植物病毒中;
(三)抗植物真菌病毒基因:
1
)几丁质酶与β—
1
,
3
—
葡聚糖酶,几丁质酶降解几丁质(聚
N< br>—
乙酰胺基葡萄糖)
,几丁质是构成真菌细
胞壁的成分,
β—
1
,
3
—
葡聚糖酶降解
β—
1
,
3
—
葡聚糖,后者也是构成真菌细胞壁的成分;
2
)植物抗毒素基因;
3)
RIP
基因:核糖体蛋白失活基因,使真菌蛋白不能合成;
4
)过氧< br>化物基因:
木质素由苯基类丙烷醇缩合而成,
它可增强细胞壁的强度,
增加抗真 菌的穿透的
压力,
而且抗原菌酶的降解,
从而限制了真菌酶和毒素向宿主扩散以及水和 营养物质从寄主
向真菌扩散,过氧化物酶催化苯基类丙烷醇脱氢酶聚合成木质素;
(四)抗植物 细菌病毒基
因:病原菌本身的抗性基因(类似于抗生素)
;杀菌肽基因(杀菌性的特异性不强, 广谱杀
菌)
;溶菌酶基因(破坏细菌的细胞壁)
。
3
.高 等植物基因转化方法:根瘤农杆菌
—
Ti
质粒系统;化学刺激法;
电脉冲法; 基因枪法;
电击注入法;脂质体法;直接注射法;激光微束发;超声波法;花粉发。
4
.
植物基因工程常用遗传选择标记:
Npt
—
II
基因< br>(新霉素磷酸转移酶基因或氨基糖苷磷酸
转移酶基因,
Aph
—
II< br>)
,
DHFP
基因(二氢叶酸还原酶基因)
;
HPT
基因(潮霉素磷酸转移
酶基因)
;
Gent
基因(庆大霉素抗性基因)
;抗除锈迹的标记基因;争光霉素(博来霉素)
抗性基因;
Blas
(杀稻瘟菌素)
;磺胺类药物。
5
.
PCR
技术原理:
DNA< br>双螺旋结构的生物功能主要是在与复制和转染,以加热或碱变性
作用可以使
DNA
双螺旋的氢键断裂,双联竭力,形成单链
DNA
,这称为
DNA
变性,解除
变性条件后,变形的单链可以重新结合起来,形成双链,其原有的活性复原,称为
DNA
复
性,又称退火,变形和复性在一定条件下是完全可逆的。
PCR
扩增是一种特定区 段
DNA
的
复制,遵循
DNA
生物合成的基本规律,其复制方法是一 般保留形式进行的,但
PCR
中的
DNA
复制必须有
DNA
模版,
DNA
聚合酶,
DNA
引物和四种
dNTP
,要扩增 模板
DNA
中
的某一片段,需设计一对寡核苷酸引物,
它们分别与两条
DNA
模板链
3’
末端互补,
PCR
扩
增系统中模板DNA
经过高温变性后,分解为两条单链,通过低温退火,引物与模板
DNA
结合 ,形成局部双链,这是
DNA
复制的固定起点,由此
DNA
聚合酶可以进行链 的延伸,
合成与模板互补的链,
模板
DNA
经过高温变性,
低温退火 和中温延伸三个阶段的循环过程,
每循环一次,模板
DNA
的拷贝数就增加一倍。
6
.
PCR
反应体系:引物(自行设计)
,模板(
D NA
来源)
,
Taq
酶(
5’
到
3’
聚合 酶活性,但
没有
3’
到
5’
外切酶活性)
,
dNT Ps
(底物)
,缓冲液(
Buffer
,含有一定的离子浓度、
pH
值)
,
BSA
(牛血清白蛋白)
,
Mg2+
(Taq
酶的辅助性因子)
。
7
.引物的设计原则:
1
)引物的长度应在
15~30bp
(一般为
18~25
左右,太小或 太长均可能
致使非特异性配对)
;
2
)
引物中碱基的分布应当是随机 的,
避免一连串单个碱基或其他不常
见的结构;
3
)
GC
碱 基的含量在
45~55%
左右;
4
)两个引物在
3’
端均必 须与模板互补,
5’
可以不互补;
5
)
引物自身连续互补碱基小于< br>4
个
(若过长,
引物自身回旋,
形成二级结构)
;
-
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