脸颊发红-
聚合酶链式反应是一种用于放大扩增特定的
DNA
片段的
分 子生物学技术,
它可看作是生物体外的特殊
DNA
复制,
PCR
的最 大特点,是能将微量的
DNA
大幅增加。因此,无论是化
石中的古生物、历史人物的残 骸,还是几十年前凶杀案中凶
手所遗留的毛发、
皮肤或血液,
只要能分离出一丁点的< br>DNA
,
就能用
PCR
加以放大,进行比对。这也是“微量证据”的威
力之所在。
由
1983
年美国
Mullis
首先提出设想,
1985
年由
其发明了聚合酶链反应,即简易
DNA
扩增法,意味着
PCR
技
术的真正诞生。到如今
2013
年,
PCR
已发展到第三代技术。
1973
年,台籍科学家钱嘉韵,发现了稳定的
Taq
DNA
聚合
酶,为
PCR
技术发展也做出了基础性贡献。
PCR(
聚合酶链式反应)
是利用
DNA
在体外摄氏
95< br>°高温
时变性会变成单链,低温(经常是
60
°
C
左右)时引 物与单
链按碱基互补配对的原则结合,再调温度至
DNA
聚合酶最适
反应温度
(
72
°
C
左右)
,
DNA
聚合酶沿着磷 酸到五碳糖
(5'-3')
的方向合成互补链。基于聚合酶制造的
PCR
仪实 际就是一个
温控设备,能在变性温度,复性温度,延伸温度之间很好地
进行控制。
荧光定量
PCR
技术检测的报告形式
一,拷贝数的意义:
表示原始标本内可供探针结合的核酸片段数量
二,拷贝数与病原体的关系:
拷贝数与病原体的数量成正相关
三,报告形式:
1
如果标本量是可以定量的,如血液等,则
检测结果报告为:
IU/ml(
可溯源到国际标准物质的标准品
)
如
HBV- DNA
:检测下限:
100IU/
毫升
即:
<1.00E+02IU/ml
如果标本不能定量,如痰液,分泌物等,则结果 只能报:
copies/
毎测试
荧光定量
PCR
< br>在
PCR
反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号累积实时
监测整个
P CR
进程,最后通过标准曲线对未知的起始模板进
行定量分析的方法。
Ct
值得意义
扩增越靠后定量的重复性就越差
--< br>扩增末期,扩增效率可能因为大量的靶序列而产生不可控
的影响,偏离线性
--
在
Ct
值处重复性非常好
--
荧光定量技术要求在低浓度进行
荧光定量
PCR
在临床中的应用
一
,
感染性疾病
1
,肝炎病毒定量检测
2
,结核杆菌及呼吸道病原体检测
3
,优生优育(
TORCH
)相关项目检测
4
,性病病原体检测
5
,手足口病相关病毒
EV71
,柯萨奇病毒的检测
二,肿瘤个体化诊断与治疗
三,遗传性疾病
四,疾病风险评估
乙型肝炎病毒(
Hepatitis B
)
HBV
基因分型与
CHB
(临床遗传性疾病)的关系
全基因组测序
HBV
可分为
A.B.C.D.E.F.G.H 8
个基因型
HBV
基因型
--HBV
基因型与病毒复制及 病毒标志物表达的关
系
--HBV
基因型临床疾病谱及疾病预后的关系
--HBV
基因型与抗病毒疗效之间有关系
血清学指标(
-
)不能排除
HBV
感染
HBeAg(-)/HBV-DNA(+)
编码
e
抗原的
pre C
区基因极易出现变异,在
pre C
区
出现终止密码子,在
pre C
区基因与
C
区基因不能 转译出完
整的
e
抗原。导致
HBeAg
表达缺失,机体感染
HBV
不表达
HBeAg
,当然血清学方法也不能检测出
HBeAg
的存在。
HBV
基因型
---HBV
基因型临床疾病谱及疾病预后的关系
--HBV
基因型是影响慢性乙型肝炎的临床转归的主要决定因
素之一。
< br>--HBV
感染的临床转归一方面决定于患者的年龄和免疫能
力,另一方面与基因型种类 密切相关。在
B,C
为优势地区,
C
型具有较强的疾病能力,
预后差 ;
在以
A,D
为优势的地区,
D
型具有较强的致病性,肝病严重,预 后不良;基因型
C
在
乙肝后肝硬化的发病中起一定的作用,然而基因型
B与年轻
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